Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms