Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms