Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STRCQ7RTU9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCQ7RTU9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms