Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KNDC1Q76NI1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KNDC1Q76NI1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms