Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRIP1Q5VSL9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms