Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CEP170Q5SW79 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP170Q5SW79 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms