Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNT1Q5JUK3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms