Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC92Q53HC0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC92Q53HC0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms