Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC38Q502W7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms