Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC142Q17RM4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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