Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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