Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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