Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NRF1Q16656 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NRF1Q16656 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NRF1Q16656 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NRF1Q16656 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NRF1Q16656 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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NRF1Q16656 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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NRF1Q16656 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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