Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDGFRLQ15198 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms