Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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