Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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