Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms