Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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CAPSQ13938 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPSQ13938 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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