Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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SHROOM2Q13796 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
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SHROOM2Q13796 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
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