Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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