Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SGCGQ13326 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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