Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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