Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CALCOCO2Q13137 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CALCOCO2Q13137 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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CALCOCO2Q13137 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CALCOCO2Q13137 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CALCOCO2Q13137 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CALCOCO2Q13137 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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