Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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