Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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