Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPTFQ12830 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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