Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms