Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLFN5Q08AF3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms