Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms