Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms