Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TOP2BQ02880 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms