Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms