Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC5Q00444 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms