Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms