Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB1P82279 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB1P82279 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB1P82279 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB1P82279 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms