Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms