Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TMEM258P61165 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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TMEM258P61165 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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TMEM258P61165 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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TMEM258P61165 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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TMEM258P61165 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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TMEM258P61165 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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TMEM258P61165 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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TMEM258P61165 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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TMEM258P61165 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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TMEM258P61165 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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TMEM258P61165 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TMEM258P61165 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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