Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBASH3AP57075 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms