Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP6P55212 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP6P55212 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP6P55212 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms