Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBX2P52951 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms