Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KPNA1P52294 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms