Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL1P50553 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms