Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FNTBP49356 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FNTBP49356 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FNTBP49356 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms