Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTDSS1P48651 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms