Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RANGAP1P46060 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RANGAP1P46060 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms