Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NSG1P42857 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NSG1P42857 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSG1P42857 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSG1P42857 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSG1P42857 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSG1P42857 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NSG1P42857 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NSG1P42857 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms