Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPGP40121 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAPGP40121 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAPGP40121 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms