Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLT4P35916 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLT4P35916 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FLT4P35916 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FLT4P35916 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms