Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DMAP28067 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms