Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIFP27352 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIFP27352 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIFP27352 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIFP27352 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIFP27352 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIFP27352 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GIFP27352 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIFP27352 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIFP27352 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIFP27352 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIFP27352 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GIFP27352 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GIFP27352 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms